首次办理须本人至当地的出入境管理处提交申请,申请材料有:居民身份证及复印件(用A4纸复印,可复印在同一张纸上)以及填写《中国公民出入境证件申请表》,2寸淡底色彩照2张(也可现场拍照,费用自付),同时分别申请赴中国香港、中国澳门的签注。只去中国香港则申请中国香港签注,只去中国澳门则申请中国澳门签注,如果中国香港、中国澳门都去,则两地签注都要申请。
内地居民前往中国香港或中国澳门特别行政区定居,向户口所在地的市、县公安出入境管理部门提出申请。凭公安出入境管理部门签发的前往港澳通行证前往。如果没有该通行证是不能进入港澳地区的。
2014年9月15日,全面启用电子往来港澳通行证规定,成年人电子往来港澳通行证有效期延长为10年,对未满16周岁的仍签发5年有效通行证。内地居民往来港澳签注分为6个种类,即个人旅游(G)、探亲(T)、商务(S)、团队旅游(L)、其他(Q)、逗留(D)根据申请事由分类签发。
其中中国香港G签和L签的有效期都为:3个月1次、3个月2次、1年1次、1年2次四种有效签注。中国澳门签注只有3个月1次、1年1次申请。签注规定每次在中国香港或者中国澳门逗留不超过7天,一进一出算一次。